La casa discográfica pensó que era momento de cerrar esta etapa con una recopilación de los grandes éxitos del grupo. En 1988 se lanzó 'The Greatest Hits Collection', que incluía los singles más importantes de Bananarama y a además tres temas nuevos. Algunos de éstos temas fueron 'Nathan Jones' (n 15), 'Love, Truth & Honesty' (n 23), y el cover del tema de los Beatles 'Help!', que se lanzó como single benéfico y alcanzó el n 3 en las listas de UK. Después de una pausa, el grupo decidió no volver a grabar con Stock Aitken & Waterman el siguiente álbum, ya que no estaban satisfechas con los temas que estaban produciendo. Se unieron al productor Youth para lanzar en 1991 el álbum 'Pop Life', que incluía una versión del tema de The Doobie Brothers 'Long Train Running' (n 30 en UK), y otros singles que no fueron bien en las listas. 'Preacher Man' (n 20) fue el más exitoso de este álbum. Muy poco después del lanzamiento de este álbum, Jaquie también decide dejar el grupo. Keren y Sara deciden continuar como un dúo para lanzar en 1993 el álbum 'Please Yourself' producido de nuevo, bajo presión de la discográfica, por Stock & Waterman. Se extrajeron tres singles: 'Movin’ On', 'More More More' y 'Last Thing On My Mind'. Este ábum estaba planeado como homenaje a ABBA, con canciones nuevas y versión del famoso grupo sueco. El grupo Erasure se les adelantó, y tuvieron que declinar sus intenciones, dejando en algunos temas del álbum un sonido similar al utilizado por el cuarteto sueco. Ese mismo año acaba el contrato con London records y las chicas se quedan sin sello discográfico. En 1995 graban con los productores Metro (responsables años después del éxito 'Believe' de Cher). 'I found Love' que es lanzado en Japón, mientras buscan una casa discográfica que lance el disco en Europa. Finalmente el álbum es lanzado bajo el nombre 'Ultraviolet' pero no llega a editarse en UK. Los singles 'Every Shade Of Blue' y 'Take Me To Your Heart' se colocan en los primeros puestos de listas dance alternativas de USA y Canadá, donde un sello Dance independiente publica el disco.
En 1998 con motivo del programa de televisión A Song For Eurotrash, donde se realizaban covers de canciones populares de Eurovisión, Sara y Keren se volvieron a juntar con Siobhan para cantar 'Waterloo' de ABBA. En 2001 se publica bajo un sello francés, su octavo álbum de estudio 'Exotica'. Fue un disco que apenas tuvo repercusión y que se lanzó únicamente en Francia, con la promoción de un par de singles: la versión del tema de George Michael 'Careless Whisper' e 'If'. En 2003 fichan por el sello A&G y empiezan la producción de lo que será su álbum más ambicioso desde 'Pop Life'. Durante meses graban con productores como Terry Ronald, Ian Masterson, Mute8, Corp & BlackCell y Leigh Guest. A mediados de 2005 publican su primer single 'Move In My Direction', el single devuelve a Bananarama a los charts ingleses donde no habían publicado nada desde el single 'More, More, More' en 1993. 'Move In My Direction' alcanza un notorio puesto 14 en las listas, seguido de la publicación del single 'Look On The Floor' y su 9º álbum llamado 'Drama'. Bananarama sigue con la promoción de 'Drama' por todo el mundo publicándose el álbum en varios países como Alemania, Australia, Japón, Taiwán y USA.